Cours 33 Conseils de rédaction scientifique
https://docs.google.com/document/d/1Ny_bmW094guCzg8x11Td7pAbqv9EIwCB6iUyIm4WXUY/edit?usp=sharing
Cours par : Hervé Maisonneuve (médecin)
lire la BD humoristique “carnet de thèse”
33.1 Conseils généraux:
1 idée/phrase/paragraphe
1 phrase d’intro au début de chaque paragraphe donnant l’info du paragraphe
Eviter la répétition de contenu -> plan à revoir
Les articles ne font pas des sous-sous-sous parties -> simplifier le plan
il faut pas trop attendre après l’écriture pour soumettre car la littérature elle avance
une recherche non publiée n’existe pas
n’écrivez jamais sans savoir vers quelle revue on se dirige
la réanalyse…prend du temps
citer plutôt la 1ère étude
faire d’abord tjrs lire par un naïf avant soumission
restez focus dans le sujet dans la rédaction
les chiffres en toutes lettres de 0 à 10 puis en numérique
33.2 Pq écrire ? / Pq publier ?
- partage
- valoriser son labo, se donner des “points” -> poursuite de carrière +avancer dans la science
- former les autres et se former
- pour faire évaluer son travail
33.3 Les barrières pour écrire et publier :
- éviter le plagiat
- mobiliser les sources, la citation
- expliquer clairement et simplement
- proposer une mise en perspective
- l’anglais
- la procrastination
- collaboration avec co-auteurs
33.4 Que veulent les rédacteurs ?
- innovation/originalité
- dans certaines disciplines la réplication d’une recherche est valorisée
- clair/simple/concis
50-70% de ce qui est publié n’est pas reproductible
33.5 Fonctionnement d’une revue :
peer-review, aveugle ou non (60% simple aveugle (auteur connu reviewer inconnu), ouvert tt le monde connu)
Impact factor basées sur les citations
rédacteur en chef : pouvoir de régulation
relecteur récupère des idées, régule lui aussi
propriétaire de la revue a des intérêts économique
le lecteur n’a aucun pouvoir car il ne paye pas et on ne lui demande pas son avis
33.5.1 Différents types d’articles :
- éditorial
- article
- revue de la litt
- thèses, mémoires
- notes techniques, méthodes
- correspondances
- livres, chapitres
Article scientifique : - réponse à une question - modèle IMRaD : intro, mat, results, discu - tout au passé - voie active - 4000 mots environ sans résumé et ref - 7-8 pages - 30-40 citations
33.6 Introduction (3 paragraphes) (250 mots) (¼ des refs)
Etat de l’art (connu) : contextualiser le sujet du plus général (pas des faits ridiculement trop large et surconnu) au plus ciblé
gaps (inconnu) : les manques dans la littérature + hypothèses
La question
(les hypothèses)
Réponse à la question dans certaines disciplines
au passé, parfois présent
les refs : pas des tartines seulement les plus originales, importantes, pas tt le monde 25-30% des refs ne contiennent pas ce qu’on leur fait dire
33.7 Méthodes (pour que ce soit reproductible) ()
Sélection (nos choix éclairés) : design, temporalité, lieu, sélection des caractéristiques de l’objet d’étude
Data availability : accès aux données
Interventions/manipulations/observations : ce qu’on y a appliqué
- description de l’outil (marque, n°série, année)
- méthode (durée, temp, etc)
- investigateurs et la lecture : qui a manipé, combien de personnes, (juniors/seniors)
Evaluation : quelles vars évaluées
les tests préliminaires peuvent y être mis si courts sinon résultats
comment : les stats
considération éthique : y avait t-il des régulations
le protocole peut se mettre en annexe
33.8 Résultats (pas de plan par défaut, voir les consignes de la revue)
au passé
pas de ref
présentation des résultats originaux, les autres en annexes
tableau en priorité (données numériques) (ind en lignes, vars en col en général)
figures (certaines en annexe si trop long)
la figure ou le tab doit se suffir à elle même avec sa légende
texte parle de l’info principale du tab ou de la figure, ne doit pas expliquer les fig/tab
1 résultat n’est présenté qu’1 fois (tableau ou figure)
présenter nos figures à collègue naïf pour vérifier leur indépendance
la lecture commence en haut à gauche
prendre en compte ce que l’oeil doit comparer
unités des axes
éviter les 3 dimensions, les camemberts, la perspective
la double unité est moins lisible
mettre des délimitations pour indiquer où regarder sur les photos
éviter les noms d’axes verticaux
qd on n’a pas de 0 il faut couper l’axe
enlever le vide inutile
utiliser la police de la revue
Les figures : couleurs : couleurs de la revue, penser aux daltoniens et impression noir et blanc (symboles)
33.9 Discussion on discute le résultat tout le long (10-20h de travail
passé/présent/conditionnel pas de future
pas de rappel de la question
- répondre à la question (1 paragraphe) (on répète le résultat)
- forces puis faiblesses du travail (dans chacune des parties)
- comparaison avec la littérature
- signification de ce travail (optionnel) (changement de pratiques, nouvelles hypothèses, implications générales)
- perspectives
spin : abus de langage en disant que qqchose marche pas mais que ça aurait marché si… enduit le lecteur en erreur.
Les résultats positifs en plus de ça plus représentés dans la littérature que les résultats négatifs.
33.11 Les auteurs (les 4 pts validé, international)
- contribution à la conception ou aux méthodes, ou à l’acquisition, l’analyse ou interprétation des résultats
- a rédigé ou participé à la révision critique
- approbation pour la dernière version
- engagement à assumer l’imputabilité (droits) pour tous les aspects de la recherche
Ordre des auteurs (pas de recommandations, mais de pratiques, négociation entre auteurs) :
- celui qui a dirigé l’étude
- entre les deux : ordre d’implication
- le dernier : superviseur général
Si contribution égale : on le spécifie et l’ordre des auteurs on peut tirer au sort
Les revues n’exigent rien mais :
- auteurs cadeaux/honoraires : n’ont pas participé mais mis en auteurs
- auteurs fantômes : ont participé mais ne sont pas mis en auteurs
40% des conflits dans les équipes est dû à l’ordre des auteurs.
Remerciements : demander l’autorisation consentement
33.12 Références :
- tt ce qu’on utilise doit être cité
- règles selon la revue
- logiciels : zotero (très bien pour une thèse), mendeley, endnote (payant mais plus professionel)
- citation alphabétique (en ttes lettres) ou numérique (ac des numéros)
- communication personnelle cité avec son nom et avec son accord
- “données non publiées” ça n’existe plus
33.13 Titre de l’article :
court (10 mots max)
l’info essentiel de l’article (sujet, rslt principal), le message
types, informatif, neutres, marketing (jeux de mots)
abréviations que si connues
lieu mit s’il est important dans le résulat en vu de la littérature (peut faire perdre des lecteurs)
humour : pas le même selon les cultures
question ? a voir
sous-titre si besoin
effectif si original pour la thématique
Running title : titre revient au début de chaque page
Mots clefs :
https://methodsblog.com/2015/12/18/seo/
- bien choisis pour les moteurs de recherche
- pas figurant dans le titre
33.14 science ouverte : diffusion des produits scientifiques (résultats, données, écrits et code source)
principe FAIR : Findable Accessible Interoperable Reusable Dataverse Cirad : dépot de données institutionnel Si les financements sont publiques, l’étude doit être ouverte voie verte : arrêter les revues et publier sur des serveurs institutionnels voie dorée : l’institution de l’auteur paye pour publier (2000-5000e/article), pour le lecteur c’est gratuit (=open accès) voie diamant : “gratuit pour tt le monde”, c’est la revue de l’institution et c’est elle donc qui paye le personnel. Preprint : pré publication soumis ou non, relus par les pairs ou non, ou rejeté après soumission (HAL dépôt de preprint). Risques d’erreurs et de leur propagation, certaines plateformes proposent des corrections et le statut de l’article. On peut citer un préprint en précisant. PubPeer : critiques par les pairs sur des articles acceptés, en téléchargeant le plugin on est informé des critiques faites sur les articles qu’on télécharge
Revues prédatrices (surtout indiennes) (14 000) : but de faire de l’argent en proposant des prix plus bas (200-400e) mais un travail de moindre qualité (2-3 semaines), porte un nom ressemblant à celui d’une revue connue, procède par des propositions par mail (ne pas se désabonner pcq c’est pire, juste les jeter), les procédures ne sont pas transparentes. Risque pour la réputation
Orcid : open researcher and contributor iD = syst d’identification pour les chercheurs, prévient des cas de changements de noms, d’homonymie, permet de s’identifier rapidement et tout rassembler, fait son CV
33.15 Data availability:
accès aux données nécessaires à la reproductibilité, fournir les images originales déposer dans des référentiels de données publics selon thématique se conformer aux normes/fichiers d’info complémentaires, instructions aux auteurs mention “demande des données aux auteurs” ils ne les donne svt pas il est bien de donner accès sous motif d’utilisation
33.16 Résumé :
- 250-400 mots max
- à rédiger après l’article
- clarté et mots clefs
- objectifs, question, méthodes, principaux résultats (chiffrés), réponse à la question (pas discussion)
- faire du copié-collé de phrases fortes (hilights) de l’article (c’est pas du plagiat)
- dernière phrase de l’intro
- 1ère phrase de chaque paragraphe
- …
- qqfois des “graphical abstract” (schéma bilan) (bien pour publier sur Twitter)
- ou sous forme de podcast mtn !
33.19 CRediT/contributeurs :
- contributions des auteurs
- et des non auteurs qui remplissent 1 des points (collecte, analyse, recherche financements, consulté pour la méthodo, ressource matériel, supervision, rédac, relecture)
33.20 Conflit d’intérêt (relations et activités qui ont pu influencer) :
- préciser les discordances entre chercheurs
- préciser ses opinions dans le cas où ça pourrait jouer (décisionnaire, actif, dons économiques)
- préciser qui a financé
- préciser si certains relecteurs sont contre indiqués
- c’est le lecteur qui se fait un avis sur les liens exposés
33.21 Gestion du temps
combien d’heures pour écrire un manuscrit (heures étalées sur x mois) comment optimiser, s’organiser : où écrire : endroit où on y est tranquil, isolé recherche documentaire doit être faite avant et il faut arrêter temps social important pour s’ouvrir Quand écrire : même si la recherche n’est pas terminée ux moments de la journée où on est le plus productif régulièrement (un peu ts les jours) sinon on perd du temps à s’y replonger et ça démotive (dont interruption continue) . Les temps de repos sont essentiels. Ne pas attendre d’avoir une journée de libre, sinon on n’écrit jamais. 25min minimum, 3h maximum (relecture, plans, relire notes, écriture) s’arrêter avec des idées pour la suite (qu’on note) pour mieux s’y remettre effet Zeigernik : on se souvient mieux de ce qui est inachevé que de ce qu’on a terminé, le cerveau continu à y travailler conseils : discuter régulièrement avec les coauteurs pour alimenter la réflexion
Procrastination, 6 conseils :
1) pensez au futur, au calendrier, imaginez l’article accepté, etc…
2) apprendre à gérer vos émotions et les sentiments négatifs
3) Diminuer les distractions…
4) Responsabilité : revoir et préciser les objectifs
5) Demander de l’aide, car écrire est assez facile, quand on a appris…
6) Renforcez votre volonté.… de l’entraînement et des ressources et ce sera facile
33.22 Gestion des coauteurs :
constitution équipe - transparence - choix de l’ordre - plan des gestion des données - stratégie de rédaction - prendre en compte diversité culturelle et linguistique - éthique - avoir une date limite - écrire sur un drive pour écrire sur seule version
33.23 Ecriture (qqsoit la langue) :
- phrase simple courte (1 action par phrase)
- chaque mot doit être utile (enlever : kind of, really, basically, practically, actually, virtually etc)
- 15-20 mots/phrase
- pas de style
- position forte : info principale : au début de la phrase, au début du paragraphe (pas de suspens)
- forme active
- utiliser le même mot à chaque fois pour caractériser qqchose (les répétitions c’est ok)
- les mots scientifiques doivent être utilisés que dans leur cadre
- pas de double négatifs
- précision : mots, chiffres, totaux, faits, opinions, ref
- pas d’expressions émotionnelle
- peu d’adverbe (gérondif) (fr : en verbe-ant; en : verb-ing)
- ne pas utiliser des mots indéfinis : it/these/that
- éviter les démonstratifs (ces, cette etc)
- éviter de commencer une phrase par un acronyme
- pas faire de doubles parenthèses, mettre un ; entre les deux élements
- pas parler de “good” ou “bad” mais de “quality of”
33.24 Embellissement de l’article (pas bien)
- sélection de ce qu’ils mettents dans l’article
- p-value arrangée
- images modifiées
- données enlevées
- salami : segmentation d’articles en plusieurs petits
- empêche la reproductibilité
33.25 Lettre de motivation de soumission (pas tjrs demandée) :
- 1 seule page
- regarder si modèle pour la revue
- accompagne l’article
- pour attirer l’attention de la revue
- mise en évidence des découvertes et résultats importants, des objectifs communs avec la revue
- on peut dire pq on a choisi leur revue, qu’on l’a connait
- ne pas parler négativement d’un concurrent ou de politique, on ne parle que de son étude
- italique nom de la revue et des espèces
- éviter de parler de notre matériel de travail
- le manuscrit doit être original, pas déjà publié,
- pas de conflits d’intérêt
- liste des relecteurs si demandée, ou ceux qui ne devraient pas relire notre manuscrit